В связи с обострением эпидемической ситуации по коронавирусной инфекции, известной как MERS-CoV (Middle East respiratory syndrome coronavirus; синонимы: nCoV, London1_novel CoV 2012, HCoV-EMC), ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора начинает производить набор реагентов для выявления РНК коронавирусов, вызывающих тяжелую респираторную инфекцию методом ОТ-ПЦР «АмплиСенс® CoV-Bat-FL»:
Кат. номер | |
Количество тестов |
55 |
Формат детекции |
флуоресцентная в реальном времени (FRT) |
Выявляемые вирусы |
MERS-CoV (Middle East respiratory syndrome coronavirus) и SARS-CoV (Severe acute respiratory syndrome coronavirus), с дифференциацией |
Аналитическая чувствительность |
103 ГЭ/мл |
Адаптированные детектирующие амплификаторы |
«Rotor-Gene 3000» и «Rotor-Gene 6000» («Corbett Research», Австралия), Rotor-Gene Q (QIAGEN, Германия), «iQ5» («Bio-Rad», США), «ДТ-96» («ДНК-Технология», Россия) |
Рекомендуемые биоматериалы для исследования: |
- мазки со слизистой носоглотки и задней стенки ротоглотки (при наличии симптомов поражения верхних дыхательных путей), - мокрота (либо аспираты из трахеи) (при наличии симптомов поражения нижних дыхательных путей), - бронхоальвеолярный лаваж или промывные воды бронхов (если пациент интубирован), - плазма крови, - фекалии (при наличии симптомов поражения ЖКТ), - секционный материал (фрагменты пораженной части легких, бронхов) в случае летального исхода. Для исследования от пациента рекомендуется брать не менее двух типов биологического материала (материал из респираторного тракта, плазма крови и, при наличии симптомов поражения ЖКТ, фекалии). |
Режим обратной транскрипции: |
отдельная от ПЦР (two step) |
Рекомендуемый набор реагентов для обратной транскрипции: |
«РЕВЕРТА-L» (кат. номер К3-4-50) |
Рекомендуемый набор реагентов для экстракции РНК: |
«АмплиПрайм РИБО-преп» (кат. номер 104-20)
|
Согласно рекомендациям ВОЗ и CDC:
· предпочтительным методом для идентификации MERS-CoV является ОТ-ПЦР
· инкубационный период для MERS-CoV в большинстве случаев длится менее одной недели; зафиксирован случай с инкубационным периодом продолжительностью 9-12 дней
· наиболее информативным биоматериалом для исследования является материал из нижних дыхательных путей (мокрота, аспират из трахеи, бронхо-альвеолярный лаваж)
· для пациентов, у которых на основании клинических или эпидемиологических данных подозревается MERS-CoV, инфицирование не может быть исключено на основании анализа только образца из верхних дыхательных путей (мазки со слизистой носоглотки и задней стенки ротоглотки в ряде случаев были отрицательны у пациентов, заразившихся MERS-CoV будучи в контакте с инфицированными лицами; у ряда пациентов с инфекцией, подтвержденной по образцам из нижних дыхательных путей, назофарингеальные мазки были отрицательны на наличие MERS-CoV)
· при работе с биоматериалом, предназначенным для исследования на MERS-CoV, следует руководствоваться общими рекомендациями по взятию, транспортировке и хранению биоматериала для ПЦР-диагностики
Более подробную информацию о диагностике и надзору за MERS-CoV можно найти в следующих источниках: