Флороценоз

Подпишитесь
на новости ИЛС

Ваш e-mail:


(бесплатно для звонков по РФ) 8 (800) 100-28-84
+7 (495) 664-28-84

Региональные представители

О КОМПАНИИ НОВОСТИ МЕРОПРИЯТИЯ ЗАКАЗ ON-LINE ОБРАТНАЯ СВЯЗЬ ВАКАНСИИ КОНТАКТЫ

Новости компании

02.06.2016

Новый набор компании QIAGEN позволяет определять статус ALK при немелкоклеточном раке легкого


Qiagen ALK
QIAGEN выпустил новый набор реагентов для количественного анализа транскриптов ALK при немелкоклеточном раке легкого.

Разработанный компанией QIAGEN набор реагентов «ALK RGQ RT-PCR Kit (24)» позволяет определять уровень экспрессии киназного домена анапластической лимфомы ALK в опухолевых клетках при немелкоклеточном раке легкого (НМРЛ) методом ПЦР в реальном времени. Измененный ген кодирует синтез белка, ведущего к патологической активации рецептора ALK на мембране опухолевой клетки и способствует злокачественному прогрессированию.

Особенности набора ALK RGQ RT-PCR Kit

  • Высокая чувствительность
  • Возможность работы с парафиновыми блоками;
  • Совместимость с амплификатором Rotor-Gene Q (QIAGEN)
  • Для анализа одного образца используется одна пробирка

В опубликованном исследовании [1] коллективом авторов был валидирован новый высокочувствительный набор для амплификации киназного домена ALK методом количественной ПЦР в режиме реального времени, позволяющий определить гиперэкспрессию ALK, вызванную перестройками в гене.

В результате ретроспективного анализа образцов, исследованных ранее методом флуоресцентной гибридизации in situ (FISH), обнаружили, что все образцы, в которых была найдена перестройка гена ALK методом FISH, показывали наличие транскриптов ALK по результатам ПЦР в режиме реального времени; образцы, не имеющие перестройки, при проведении ПЦР выдавали отрицательный результат. Ниже представлены результаты исследования по чувствительности и точности нового метода.

Чувствительность

Для оценки чувствительности метода, РНК из клеточной линии H2228 титровали в РНК, выделенной из ткани нормального легкого, с 100%, 50%, 15%, 5%, 1% и 0% коэффициентом разбавления, соответственно. ALK транскрипты детектировались при разбавлении 100%, 50% и 15%. (рис. 1). Ct для ALK составил ≤36.9, для ABL1 - Ct≤36.4.

Рисунок 1

Рисунок 1. Анализ чувствительности метода.

Точность

Все 15 образцов с трансклокацией ALK, включая 12 образцов от пациентов, 2 образца клеточных линий и 1 положительный РНК контроль, показали положительный результат при анализе транскрипта ALK в сравнении и ABL1 в качестве контроля амплификации (рис. 2). Клиническая чувствительность анализа составила 100% (15/15; 95% доверительный интервал: 78%–100%).

21 образец без транслокации ALK, включая 19 образцов от пациентов (рис. 2), 1 контрольный образец РНК из здоровой ткани легкого и 1 отрицательный РНК контроль, показали отсутствие амплификации транскрипта ALK в сравнении с ABL1. Клиническая специфичность составила 100% (21/21; 95% доверительный интервал: 83.8%–100%). Все 36 образцов показали совпадение результатов с методом FISH. Таким образом, точность анализа составила 100% (36/36).


Рисунок 2

Рисунок 2. Корреляция между количеством транскриптов ALK, анализируемых методом ПЦР в режиме реального времени, и наличием перестроек ALK, выявленных методом FISH.

Таким образом, авторы пришли к выводу, что анализ транскриптов ALK методом ПЦР позволяет быстро определять наличие перестроек гена, может быть совмещен с анализом гена EGFR и не требует забора дополнительного объема опухолевой ткани.


Согласно рекомендациям Российского общества клинической онкологии (RUSSCO), в случае обнаружения НМРЛ обязательной процедурой для выбора тактики терапии является проведение молекулярно-генетического исследования на наличие транслокаций гена ALK. В частности, для терапии НМРЛ, зарегистрирован препарат Кризотиниб, при использовании которого отмечается высокая частота (>60%) полных и частичных регрессов при ALK-позитивном раке легкого.


Источник:

1. Liu, C., Pepper, K., Hendrickson, H., Cagle, P.T., Portier, B.P. (2015). Clinical Validation of a Novel Commercial Reverse Transcription–Quantitative Polymerase Chain Reaction Screening Assay for Detection of ALK Translocations and Amplifications in Non–Small Cell Lung Carcinomas. Arch Pathol Lab Med, doi: 10.5858/arpa.2015-0419-OA (см. на сайте archivesofpathology.org)

Подробную информацию о наборе реагентов ALK RGQ RT-PCR Kit (24) можно получить здесь.

Набор реагентов ALK RGQ RT-PCR Kit (24) не предназначен для медицинских целей на территории РФ.

ВКонтакт Facebook Одноклассники Twitter Яндекс Livejournal Liveinternet Mail.Ru

Назад к списку новостей